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metadata.dc.type: Dissertação
Title: MARCADORES MOLECULARES ASSOCIADOS AO EFEITO DAS ATIVIDADES DE CULTIVO NO MEXILHÃO PERNA PERNA (MOLLUSCA:MYTILIDAE)
metadata.dc.creator: Malaquias, Graziela Sedrez
metadata.dc.contributor.advisor1: Conceição, Laura Isabel Weber da
metadata.dc.description.resumo: O mexilhão Perna perna é um mitilídeo de grande importância como fonte de alimento para as famílias litorâneas, sendo extraído como adulto, para consumo local, e como semente, para sua utilização nos cultivos. Além da importância como fonte de alimento, a família Mytilidae possui a capacidade de se fixar no substrato utilizando o bisso, sendo que os genes que codificam para as proteínas do bisso são de grande interesse científico e tecnológico. A principal proteína do bisso é a fp-1, que confere aos mexilhões vantagens adaptativas importantes na adesão ao substrato. Assim, o gene que codifica essa proteína tem grande potencial para avaliar o efeito da atividade de cultivo. O objetivo desta pesquisa foi analisar geneticamente estoques naturais e de cultivo do mexilhão Perna perna na região de Penha (SC), utilizando marcadores RAPDs; e procurar fragmentos candidatos que correspondam à região do éxon longo da fp-1 de P. perna, através da utilização de combinações de primers aleatórios e específicos da fp-1. Indivíduos foram coletados em duas réplicas no cultivo da Enseada da Armação do Itapocoroy; e dos costões rochosos sul (de área mais exposta) e norte (de área mais protegida) da Praia Vermelha, município de Penha, Centronorte Catarinense. Foram analisados um total de 366 mexilhões, sendo estes separados nas classes ontogenéticas de sementes, juvenis e adultos. O DNA foi extraído através das metodologias Fenol/clorofórmio e Salting-out. Foram testados 16 primers na obtenção de marcadores RAPDs, através da amplificação de DNA pela Reação em Cadeia da Polimerase (PCR), sendo escolhido o primer OPA-7 para o estudo da composição genética de estoques naturais e de cultivo (primeiro objetivo). Todos os primers testados foram utilizados em combinação com os específicos Me13, Me14 e Me15 na procura de fragmentos candidatos ao éxon longo da proteína do bisso de P. perna (segundo objetivo). Com o OPA-7 foram obtidos padrões de 14 bandas, analisadas cada uma como loco bialélico (presença e ausência do sítio amplificável). A partir da análise genética dos 14 loci, constatou-se diminuição da diversidade genética de juvenis para adultos no estoque natural e um aumento da diversidade nestes estágios ontogenéticos no estoque de cultivo. Foram encontradas diferenças significativas entre norte e sul do estoque natural da praia Vermelha, mas para o estoque de cultivo, somente foram encontradas diferenças significativas entre as réplicas da classe maior de adultos, classe não observada no estoque natural. Não houve diferenças entre as sementes, utilizadas pelos pescadores, e os juvenis dos cultivos, no entanto, mostrando grandes diferenças com os juvenis do estoque natural. Tendências na variação das freqüências alélicas foram observadas para alguns locos com o aumento do tamanho, sendo que para três loci o estoque de cultivo mostrou a mesma tendência do estoque do norte (protegido), tendência oposta à observada no costão sul (exposto). Na procura pelo éxon da pf-1 de P. perna, foram encontrados 6 fragmentos de 2700-3400pb, candidatos a serem parte do gene da proteína do bisso. Os resultados deste estudo mostram elevada heterogeneidade genética numa micro-escala e instabilidade genética temporal (diferenças entre gerações) para a espécie, onde a variação da composição genética poderia estar explicada por processos como seleção, heterose e deriva genética como discutido no texto.
Abstract: Perna perna is a mytilid mussel of great importance as food resource for local families, therefore it is extracted as adult for direct consumption, and as seeds for culture implementation. Also, the Mytilidae have the capacity of attaching to the substrate by the strength of the byssus. The genes, which codify for byssus proteins are of great scientific and biotechnological importance. Its main protein, the fp-1, allows mussels to have important adaptative advantages by the adhesion to the substrate. So, it has the potential to be used as molecular marker for evaluating the effect of culture on natural stocks. The aim of this work was to analyse genetically natural and cultured stocks of Perna perna mussel in Penha (SC), using RAPDs markers; and to search for fragments candidates to be part of the giant exon of the fp-1 of P. perna, by combining random primers with specific ones obtained from Mytilus genes. Individuals were collected in replicates from the culture localized in the Enseada da Armação do Itapocoroy; and from southern (from exposed area) and northern (from protected area) intertidal zone of Praia Vermelha, Penha, Central-north of Santa Catarina. A total of 366 mussels were analysed and divided into the ontogenetic classes of seeds, juveniles, and adults. DNA was extracted by Phenol/Chlorophorm and Salting-out methods. Sixteen primers were tested looking for RAPD molecular markers, by the amplification of DNA by the Polymerase Chain Reaction (PCR). Primer OPA-7 was chosen for studying the genetic composition of natural and cultured stocks (first aim). All random primers tested were used for combining with the specifics ones Me13, Me14, and Me15, for searching candidates of the fp-1 gene region from Perna perna (second aim). Using OPA-7 primer, it was obtained patterns of 14 bands, each of them analysed as bi-allelic locus (presence and absence of the site able to amplify). The analysis of the 14 loci showed that in natural stocks genetic diversity decreased from juveniles to adults, while in cultured stock was observed an increase of the diversity in these ontogenetic stages. Significant differences were found between south and north of the natural stock, while in the cultured stocks were observed differences only in the biggest class size of adults, which class was not observed in the natural stock. No differences were found between seeds, used by fishermen, and juveniles from culture, but great differences were found with those of natural stock. Changes in allele frequencies were observed at some loci related to the increase in size. At three loci, the same pattern of variation in allele frequency was shared by the cultured and northern (more protected) natural stocks, showing opposite variation to the southern one (more exposed). During the search for fragments of the giant exon, it was found six DNA fragments of 2700- 3400bp, candidates to be part of the fp-1 gene of P. perna. The results of the present study showed high local genetic heterogeneity in a micro-scale and temporal genetic instability (differences among generations) for the species, on which variation in genetic composition may be explained probably by some processes like selection, heterosis, and genetic drift , which were discussed in the text.
Keywords: perna perna
RAPDs
cultivos
proteína do bisso
fp-1
perna perna
RAPDs
cultures
byssus protein
fp-1
Gestão ambiental
metadata.dc.subject.cnpq: CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA
metadata.dc.language: por
metadata.dc.publisher.country: BR
Publisher: Universidade do Vale do Itajaí
metadata.dc.publisher.initials: UNIVALI
metadata.dc.publisher.department: Tecnologia e Gestão Ambiental. Ecossistemas Aquáticos
metadata.dc.publisher.program: Mestrado em Ciência e Tecnologia Ambiental
Citation: MALAQUIAS, Graziela Sedrez. MARCADORES MOLECULARES ASSOCIADOS AO EFEITO DAS ATIVIDADES DE CULTIVO NO MEXILHÃO PERNA PERNA (MOLLUSCA:MYTILIDAE). 2007. 138 f. Dissertação (Mestrado em Tecnologia e Gestão Ambiental. Ecossistemas Aquáticos) - Universidade do Vale do Itajaí, Itajaí, 2007.
metadata.dc.rights: Acesso Aberto
URI: https://siaiap39.univali.br/repositorio/handle/repositorio/1902
Issue Date: 30-Apr-2007
Appears in Collections:Importação Nova 20150826 Coleção

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